ジオンは赤いガンダムが暴走した過程を把握している
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ガンダム量産化の技術はある
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サイコミュの乗っける技術もある
フラナガン博士も生きている
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白いガンダムは赤いガンダム(サイコミュ版)を丸々コピーして
暴走のからくりを解明するためにわざと暴走させようとしている技術実証機
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でもエグザベ君無能だったんで暴走できませんでした
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無数のハロをコロニーに蒔いて、ボクと契約してガンダムパイロットになってよ！を実施
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マチュさん、引っかかる

こういうことですか

緑のおじさんの目的は、マチュをわざと暴走させて
マチュがどこに吹っ飛ばされるのか、行き先を確認すること
そしてその先に居るかもしれないシャアを見つけて何とかして愛人にすること
後はギレンとキシリアを消して、シャリア公国の公王になること

話の流れとしてはそんな流れでしょう