ガノンは単にハイラル支配したい感じだった

姫様が遡った時代ではガノンが普通に生きていて特に悪さもしていなかったけど
当時の王妃の勾玉を奪って強大になり
王様が差し違える形で封印した

ガノンが封印されて平和になったあと
ゼルダはボロボロになったマスターソードに聖なる力を与えるため
竜になって長い間（ハイラル建国から現代のリンクがいる時代まで）剣に力を与え続けて
リンクが修復されたマスターソードを手にするのを待ってた