確か今作も「消してからは同期されなくなるけど、既に同期された世界から消滅したりはしない」って説明がゲーム内で出てたと思うから、
>>29の「Redditで見た」が嘘なんじゃない？

1.建物を消す
2.その建物が同期される世界がこれ以上増えなくなる3.アクティブユーザーの中でその建物を持ってる人の人数が減って来たら素材投入の頻度が落ちる
4.誰も素材入れない期間が続いて消滅

今作もこの流れだと思う