>>4の説明にちゃんと書いてあるじゃん
製品版に影響があるのはニブルヘイム編のクリアフラグだけ
ジュノンエリア編は製品版に一切関係なし
あくまでクリア特典のみで製品版へのセーブ引継ぎとかはない