聖樹と一体化したのは恐らくミケラ/トリーナどちらかの意思なのは間違いなので
モーグが聖樹からミケラパクった理由としては

・単にモーグの趣味
・ミケラは二重人格、トリーナは聖樹になるのを望んでいたが
　ミケラは望んでいなかったのでモーグ操ってパクらせた
・事前にモーグを魅了していたのがあだになって予想外の行動をされた

この３つのうちのどれかだよな