その辺はエピがソティスにアガルタは焼かれた～的なこと言ったりするけど
本編アビス書庫じゃノアの方舟みたいな洪水でアガルタ文明一掃してるような記述があるんで
なんかもうよくわかんね…スタッフそこまで考えてないんじゃない？