時系列が分かりづらいっていうより外伝だから本編と合流する場面以外は細かく設定されてないってのが正しい
個人的には原作知らないと4話の安芸先生と東郷の場面に戻るまで防人の時系列が確定しないのも分かりづらくしてる要因だと思う