以前から監督は、腐女子受け狙いでわざと男2人に設定にした訳じゃないと語ってる。(想像する分には視聴者の自由にさせてるようだが)

「物語の初期設定を書く際、ダイブ能力を2つに分けることにした。男女コンビも当然考えたけれど、異性同士が遠慮なく心を許し合う状態というのは、単なる友情を超えた関係でないと(肉体関係/恋愛関係にないと)難しいのではないかと考えた。ラブロマンスを描きたい訳ではないし、脚本家としては物語に集中してほしい。
そこで、最終的に男性2人を主役に据えることにした。親密な兄弟のような関係なら、腹を割った描写ができるだろうと」

「男2人の物語を書いたのは、売れるからでもセールスポイントとして優れているからでもなく、ただの成り行き。執筆当時に"これだ"と感じたからそうした。"1+1=2を超える"効果を発揮させようとした際、同姓同士のほうがやりやすいと。
僕は自分の判断は間違いなかったと感じているし、こうして彼らの話をすることを恥ずかしいとは思わない。実際、男ってそういうものだし。だからこそ、真っ直ぐで無邪気な関係が築ける」
とコメントしてる。

そのへんの詳細は
『时光代理人 第一季完結記念 放映见面会(時光代理人 第1期完結記念上映会見)』
『时光代理人 导演李豪凌:下一季更精彩(時光代理人 代表取締役 李豪凌:第2期の更なる飛躍について)』
『动画导演李豪凌开腔 时光代理人:双男主设置是顺势而为(アニメーション監督 李豪凌が語る 時光代理人:男性2人組の設定は自然な流れだった)』

あたりで検索かけると、監督のリアクション含めて楽しめると思う。参考までに。