千束の生死については、ミカが親としての強権発動で手術強制執行で良かったと思うよ
その上でシンジの白紙メッセージカードとアランチャームを渡して、今後どう生きるかについては千束の自由意志に任せるっていう
バランスの取れた良い落とし所だと思う