京都編　2クール24話
1東京組各自出発、操登場（旧作1話分カット）
2小田原～崖飛び
3新月村①館入りまで
4新月村②尖角・宗次郎（3話と合わせて旧作1話分カット）
5下諏訪
6京都到着、新井青空登場
7vs張
8師匠登場
9蒼紫vs翁、奥義伝授（8話と合わせて旧作1話分カット）
10十本刀集結、左之合流～港へ
11京都大火、煉獄戦
12決戦前夜

13比叡山到着、vs安慈①
14vs安慈②
15vs宇水、vs蒼紫①
16vs蒼紫②（15話と合わせて旧作1話分カット）
17葵屋攻防
18超人vs巨人
19vs宗次郎①
20vs宗次郎②（19話と合わせて旧作1話分カット）
21志々雄①
22志々雄②
23志々雄③（21、22話と合わせて旧作1話分カット）
24エピローグ（旧作1話分カット）