本編後5年で刀振るえなくなるっていう公式設定だったから
剣客生命終わったあともクライマックスの誓いに基づいた贖罪人生を真っ当しようとすると自ずと戦災復旧や弱者の介助活動に行き着くから
その流れで当時流行してた感染症にかかるってのは自然っちゃ自然
あれは梅毒を模した架空の病気で罰のメタファーだから
誰よりも剣心自身が自分の過去に罪を感じてる訳だから、贖罪を課してる主人公の最期としては妥当だと思う
というかほんとに誓い通りに生きたらまぁあれじゃなくともあれに近い終わりにはなると思う