碑文のクエストとか時の神殿屋上のクエスト見る限りでは空島はずっと昔から浮いてるはずだけどゲーム内ではガノンドロフの封印解けた日に突然現れたと認識されてる
ゼルダが過去に跳んで歴史がズレたのは間違いないんじゃねーかな