暴力行為
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2006年12月15日夜、友人らと一緒に訪れた池袋の飲食店で店側とトラブルとなり、女性店主に暴力をふるったとして被害届が出されていると報じられたが[15]、その後示談が成立し起訴猶予処分となった。

不適正報酬
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学校法人敬愛学園が運営する私立幼稚園・箕田幼稚園の理事長と事務長とを兼任しているが、2012年11月から12月にかけての計22日間に亘り、欠勤していたにもかかわらず、無欠勤の場合と同様に報酬を受け取っていたことが、2014年に判明した。埼玉県は、国が定めた給与規定に違反するとして同園に改善指導を行い、中根は欠勤分を返還している[16]。

秘書問題
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2015年、公設秘書が「逮捕監禁致死罪」で懲役6年の実刑判決を受けた人物であることが報じられた。同秘書は、議員会館の中で、「俺は人を殺している」などとうそぶき、恐れをなした同僚秘書が何人も辞めていると報じられた同年7月に辞職している[17]。

裏金問題
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中根一幸衆院議員（比例北関東）は2018〜22年の5年間で1860万円の記載漏れがあったと書面で発表した。1月31日に訂正した収支報告書で寄付収入などとして新たに記載した。一方で、20〜22年の報告書はいずれも、前年からの繰越金を記入する欄に「不明」と記入している。 [18]。

統一教会との関係
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2021年11月7日に行われた、統一教会系の国際勝共連合と勝共UNITEが共催して開催中の憲法改正イベント「救国救世勝共大会2021」において、ビデオメッセージを寄せた。

2世信者が中心である勝共UNITEの会員に向け、「今日は若い方々がたくさん参加をされているということでございます。次の時代にしっかりと守るべきものは守り〜（中略）わたくし衆議院議員中根一幸も皆さまと一緒にしっかりとそういった素晴らしい日本を作っていきたいと思います」と述べた[19]。