沖縄県は、別枠で沖縄振興予算3000億円を貰っています。
財政移転を比較するなら同じ人口、面積で比較するのが妥当だ。
人口140万人程度の類似県と沖縄県の国から財政移転の比較

　　　　　　　　　　　 　　　　沖縄 　　　　　 愛媛 　　　　　滋賀
1、国庫支出金 　　　　　　　2000億円 　　　　788億円 　　　573億円
　　　　 　　　（一括交付金1200億円含む）
2、地方交付税　 　　　　　　2000億円 　　 1600億円 　　1100億円
3、国の公共工事投資額 　　1540億円 　　 　330億円 　　 146億円
4、単位面積当たり　　　　２億４千万円　　４千８００万円　４千５００万円
　　（1平方キロ）　

（国庫支出金と地方交付税は平成30年度の各県のホームページ、
国の公共事業投資は国土交通省の「都道府県別公共投資の推移」の平成29年度を参照）

沖縄県の国庫支出金と国の公共工事投資額が飛びぬけて
高いのは沖縄振興予算による。

沖縄振興予算＝一括交付金+国直轄事業や地方自治体への補助事業などの公共事業費。
つまり、他県においては県が主体となってやるインフラ整備を沖縄県に限っては内閣府が丸抱えでやっている。
そのうちの半分程度を一括交付金として、沖縄県の国庫支出金に上乗せしてある。
沖縄振興予算の補助率は90から95パーセント。
他県の公共事業の国の補助率は50から60パーセント。
https://www8.cao.go.jp/okinawa/siryou/singikai/senmoniinkaigou/1/01-06.pdf