ストーリーの分岐の事ならステは全く関係ないよ
あれは戦闘前にこの戦闘には特殊な条件があります？的なアナウンスがあるからそれをしくじれば勝手にBADに行く

ステが関係あるのはホーム画面のカレンダーにある定期テストとか文化祭体育祭とかの行事
そこで必要なステータスを満たしていると特殊なイベントが見れたり信頼度ポイントが貰えたり良いことがあるよってだけ

後半になるにつれて信頼度ポイントクッソ必要になるからなるべくクリアしたほうがいいけどね